A estrutura do curso compõe uma matriz curricular de 56 disciplinas divididas em 40 disciplinas do curso Básico e Médio e 16 disciplinas do curso Avançado em Teologia. Ao concluir 24 disciplinas das 40 que compõem a matriz curricular do curso Básico e Médio, independente das matrículas feitas ou de sua ordem, o aluno poderá requerer o certificado do curso Básico em Teologia e, ao concluir as outras 16 disciplinas, poderá requerer o certificado do curso Médio em Teologia. Já ao concluir as 16 disciplinas restantes, ou seja, após toda matriz curricular, o aluno poderá requerer o certificado do curso Avançado em Teologia. Cada disciplina tem seu respectivo livro-texto, elaborado para ser ministrado em módulos e, cada disciplina é estudada em quatro aulas (uma por semana) num período de 30 (trinta) dias, com carga horária de 30 (trinta) horas/aula para cada livro-texto. A partir e de acordo com as indicações do manual de Diretrizes e Bases Normativas do Conselho de Educação e Cultura da CGADB, o Avançado em Teologia da Faculdade Refidim propõe uma matriz curricular com carga horária total de 1.680 horas-aula, mais 80 horas de Estágio. São oferecidas 56 disciplinas em 30 horas-aula para cada disciplina.
A Escola Preparatória de Obreiros Siloé (EPOS) faz parte do Programa de Extensão da Faculdade Refidim, cuja coordenação está a cargo do Prof. Dr. Ailto Martins. O objetivo deste projeto é apresentar todos os procedimentos para a abertura e funcionamento dos núcleos da EPOS, padronizar e minimizar as dúvidas dos coordenadores referentes a toda dinâmica do desenvolvimento dos núcleos.
Cada disciplina tem seu respectivo livro texto, elaborado para ser ministrado em módulos em que cada disciplina é estudada em quatro aulas (uma por semana) num período de 30 (trinta) dias, com carga horária de 30 (trinta) horas/aula para cada livro texto.
01 – Teontologia
02 – Evangelismo
03 – Antigo Testamento 1 (Pentateuco)
04 – Educação Cristã
05 – Cristologia
06 – Antigo Testamento 2 (Históricos)
07 – Missiologia
08 – Hermenêutica
09 – Ética Cristã
10 – Soteriologia
11 – Novo Testamento 1 (Evangelhos e Atos)
12 – História da Igreja
13 – Homilética
14 – Eclesiologia
15 – Novo Testamento 2 (Epístolas Paulinas)
16 – Teologia Pastoral
17 – Sociologia do Antigo Testamento
18 – Hamartiologia (Pecado)
19 – Administração Eclesiástica
20 – Pneumagiologia 1 (Pessoa do Espírito Santo)
21 – Português
22 – Bibliologia
23 – Antigo Testamento 3 (Poéticos)
24 – Sociologia do Novo Testamento 1
25 – Métodos de Estudo da Bíblia
26 – Família Cristã
27 – História do Pentecostalismo
28 – Angelologia
29 – Antigo Testamento 4 (Profetas Maiores)
30 – Didática
31 – Antropologia
32 – Liderança Cristã
33 – Antigo Testamento 5 (Profetas Menores)
34 – Escatologia
35 – Novo Testamento 3 (Epístolas Gerais e Apocalipse)
36 – Pneumagiologia 2 (Dons e Fruto)
37 – História das Religiões
38 – Geografia Bíblica
39 – Sociologia do Novo Testamento 2
40 – Heresiologia
42 – História e Teologia do Culto Cristão (Liturgia)
43 – Teologia da Espiritualidade
44 – Teologia Pentecostal
45 – Introdução à Filosofia
46 – Estudos em Ciências Sociais
47 – Tópicos em Teologia Contemporânea
48 – Cultura Judaica I
49 – Cultura Judaica II
50 – História das ADs I
51 – História das ADs II
52 – Mentoria e Discipulado Cristão
53 – Estudos em Psicologia
54 – Ética e Bioética
55 – Aconselhamento Cristão
56 – Pedagogia Aplicada
